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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 网络信息临床药理学证明草酸钙肾结石钝化应激状态和炎症病变挫裂伤缘由

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿系統最喜欢见的病症之六。肾策划 中CaOx尖晶石过是处于饱和状态积聚会致使肾小管体细胞伤害和凋亡,才能致使肾结石的演变成。短链碳水化合物酸由肠内内生物滤池日常细菌发效营养健康黏胶纤维诞生,往往在身体局部肠内防线中表现意义,还有就是在系統横向上也表现核心意义。中间,丁酸是最非常丰富的短链碳水化合物酸,含有抗感染和抗体减缓意义,本论述研讨丁酸对CaOx肾结石的意义举例说明隐藏的靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山的医院泌尿整形外科吴忠先生、周子健教授于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠传授、周子健博士生在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱动物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了网站药理学学服务的,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

好的文章英文名称:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 买家厂家:华山诊所 学习对方:大鼠、HK-2人体细胞 分组名数据:对比组(Con)、3d模型组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱给予的技术:微信网络药学学检侧

思维过程流程图图

实验数据

理论研究方案人员管理一方面创造出一个大鼠对建模,实现生理学生化学技术指标和组建病检学固色等理论研究方案技术遇到丁酸还可以变少CaOx对建模大鼠肾CaOx硫化锌的组成和直接断裂,有效改善CaOx对建模大鼠的发炎直接断裂和防阳极氧化物质的优化表答。再者,丁酸还可可以抑制草酸介导的HK-2上皮细胞系直接断裂、防阳极氧化应激反应和上皮细胞系凋亡。 为来探寻丁酸框架的和靶dna网咯上,钻研员从PubChem提取丁酸和丁酸酯的二维和三维图像框架的(图1A)。可以通过PharmMapper数值库和Uniprot数值库处理后共建立出116个丁酸靶dna供进一歩概述。将dna下拉列表添加STRING数值库,来PPI网咯上概述。Cytoscape列出了顺序的前20的核心靶dna的相信网咯上图,例如CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。这核心dna与网咯上中的另一dna均表达出固定的很重要性性性,说这dna几率充分利用出着融合效应。GO和KEGG概述揭露了丁酸核心dna的很重要性性条件和生物体技术学职能(图1C)。核心dna重点与类固醇肾上腺素对答、钝化应激现象生理化学现象对答、催化抗逆性氧神经元对类固醇肾上腺素激起的生理化学现象甚至对咸性普通机械产品的生理化学现象有关。结合以上所说,这核心dna重点参予了钝化应激现象生理化学现象和对催化抗逆性氧的生物体技术生理化学现象流程,是肾结石生成新机制中至关很重要性的条件,这反映丁酸几率在肾结石中充分利用出很重要性效应。

图1| 丁酸构成与靶DNA线上介绍(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进十步探讨丁酸对CaOx肾结石真是切靶什么是dna,探究探讨有关系员工利用GEO动态数据文件源对GSE73680中键康對照与CaOx肾结石病人的什么是dna一定的差异开展了探究探讨。對照组与CaOx结石病人的差异性性一定的差异表示方法什么是dna(DEGs)产前筛查基准为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共筛分到3783个什么是dna会发生差异性转变,其中的3379个(89.4%)什么是dna表示方法上浮,404个(10.6%)什么是dna表示方法下降(图2A)。对DEGs开展聚类算法概述概述,热图显示信息了前10个被选中DEGs的二维上下分层聚类算法概述特证(图2B)。随即,探究探讨有关系员工能够GeneCards动态数据文件源人工工资鉴定结论了370个或许与CaOx肾结石有关系的什么是dna,排行前20位的估计什么是dna十分有关系性评分系统如图甲如图2C如图。要寻找丁酸医疗CaOx肾结石的的关键靶点,探究探讨有关系员工将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关系什么是dna操作赢得了了个Venn图。终结,CYP2C9被敲定为丁酸印象CaOx肾结石的潜在的靶点(图2D)。还有,探究探讨有关系员工还开展了丁酸与CYP2C9的分子结构衔接,CYP2C9的6个蛋白质残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸相互间功用,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在完成网站药学学預測CYP2C9是丁酸影响到CaOx肾结石的靶DNA后,探讨人数还完成组织神经细胞检测表明了CYP2C9可降底草酸诱发的HK-2组织神经细胞的ROS情况、宫颈炎症伤到和凋亡。

图2| 而言据库合作数据分析預测CYP2C9是丁酸功用于CaOx肾结石的靶DNA

研究探讨效果

本探讨先找到丁酸在休外和身体均能治理和改善CaOx肾结石型号的钝化应激状态状态和真菌感染损坏,己经依据wifi微信网络临床临床药理学建立达到丁酸危害CaOx肾结石的隐藏靶点——CYP2C9,第三依据内部實驗否认CYP2C9在草酸盐诱导性的HK-2内部ROS水准、真菌感染损坏和凋亡。这找到体现了丁酸很有可能依据治理和改善CYP2C9来治理和改善CaOx肾结石的钝化应激状态状态,得到缓解真菌感染损坏。该方式中拜谱生物工程技木可以提供了wifi微信网络临床临床药理学技木车辆,除外拜谱生物工程技木可提高自己发育成熟成熟的基因组组学、球营养素组学、产生组学等多个学车辆及技木车辆,邀请顾问顾问! 选取文献综述:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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